В 1979 году при проведении комплексной проверки организации предварительного следствия в следственных аппаратах органов государственной безопасности члены комиссии обратили внимание на необходимость более качественной подготовки ведомственных высококвалифицированных следственных кадров. Для этого в ВШ КГБ СССР имени Ф.Э. Дзержинского был создан следственный факультет.
В штат следственного факультета были переданы кафедра уголовного права и уголовного процесса, методический кабинет юридических дисциплин, специальная кафедра № 4 (кафедра криминалистики) и специальная криминалистическая лаборатория. С этого момента следственный факультет с полным правом стал называться учебно-научным и административным подразделением ВШ КГБ СССР с присвоением порядкового номера 10.
Первым начальником факультета был назначен кандидат юридических наук, доцент полковник Михайлов Ю.М., ранее занимавший должность доцента специальной кафедры № 4.
С 1 сентября 1979 г. факультет стал осуществлять подготовку специалистов для следственных подразделений КГБ СССР по 5-летней программе обучения. Девизом факультета на многие годы стала фраза, произнесенная Ю.М. Михайловым на одном из служебных совещаний: «Следственный факультет последний по нумерации, первый по делам!». Этот девиз реализовался в учебных и спортивных результатах слушателей и показателях служебной деятельности.
С 2008 году следственный факультет стал структурным подразделением института подготовки оперативного состава Академии. В состав факультета помимо непосредственно его сотрудников вошли также и 5 юридических кафедр, участвующих в реализации образовательных программ по всем специальностям Академии.
Совершенствование подготовки следователей для органов федеральной службы безопасности, повышение уровня их профессиональных качеств является одной из приоритетных задач образовательной деятельности Академии. В системе ведомственных образовательных организаций только Академия готовит кадры для следственных подразделений органов безопасности, а качество подготовки выпускников обеспечивает их интеллектуальное и профессиональное превосходство над своими потенциальными оппонентами.
На следственном факультете реализуется базовый поток подготовки по специальности «Правовое обеспечение национальной безопасности», направлению специальной профессиональной подготовки «Предварительное следствие в органах безопасности».
Помимо общеобразовательных и общеюридических дисциплин слушатели факультета изучают дисциплины специализации, в ходе которых осуществляется моделирование деятельности действующего сотрудника следственных подразделений.
В рамках обязательной военной подготовки изучаются дисциплины оперативно-тактической направленности, проводится специальная физическая и стрелковая подготовка. Обязательным элементом обучения является итоговая аттестация, в рамках которой предусмотрено проведение следственных учений.
Под руководством опытных преподавателей слушатели факультета участвуют в научно-исследовательской работе, занимаются в слушательском научном сообществе и кружках, готовят научные рефераты, доклады для научно-практических конференций. Научно-исследовательская работа слушателей проводится по приоритетным направлениям подразделений органов безопасности, что способствует целевой специализации слушателей применительно к будущей профессии.
Выпускники следственного факультета способны решать профессиональные задачи по организации и осуществлению предварительного следствия по уголовным делам о преступлениях, отнесенных к подследственности органов безопасности, оказывать методическую и правовую помощь оперативным подразделениям органов безопасности в их деятельности по выявлению, предупреждению и пресечению противоправных деяний, направленных на нанесение ущерба безопасности Российской Федерации.
Выпускники факультета проходят службу во всех следственных подразделениях органов безопасности и других правоохранительных структурах Российской Федерации, где успешно выявляют, предупреждают, пресекают, раскрывают и расследуют преступления. Они являются востребованными специалистами не только в системе органов ФСБ России, но и в других государственных органах и учреждениях.